Ular – selat Cina dan kobra Cina – mungkin merupakan sumber asli dari virus corona yang baru ditemukan yang telah memicu wabah penyakit pernapasan yang mematikan di Tiongkok musim dingin ini.
Penyakit ini pertama kali dilaporkan pada akhir Desember 2019 di Wuhan, sebuah kota besar di Cina tengah, dan telah menyebar dengan cepat. Sejak itu, para pelancong yang sakit dari Wuhan telah menginfeksi orang-orang di China dan negara-negara lain, termasuk Amerika Serikat.
Dengan menggunakan sampel virus yang diisolasi dari pasien, para ilmuwan di Cina telah menentukan kode genetik virus dan menggunakan mikroskop untuk memotretnya. Patogen yang bertanggung jawab atas pandemi ini adalah virus corona baru.
Virus ini ada dalam keluarga virus yang sama dengan coronavirus sindrom pernafasan akut parah yang terkenal (SARS-CoV) dan coronavirus sindrom pernafasan Timur Tengah (MERS-CoV), yang telah menewaskan ratusan orang dalam 17 tahun terakhir. Organisasi Kesehatan Dunia (WHO) telah memberi nama coronavirus baru ini sebagai 2019-nCoV.
Kami adalah ahli virologi dan editor jurnal dan sangat mengikuti wabah ini karena ada banyak pertanyaan yang perlu dijawab untuk mengekang penyebaran ancaman kesehatan masyarakat ini.
Gambar mikroskopis elektron, mengungkapkan detail struktur bentuk mahkota yang menjadi coronavirus. Gambar ini adalah coronavirus sindrom pernafasan Timur Tengah (MERS-CoV). National Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID)
Apa itu coronavirus?
Nama coronavirus berasal dari bentuknya, yang menyerupai sebuah mahkota atau korona matahari ketika dicitrakan menggunakan mikroskop elektron.
Coronavirus ditularkan melalui udara dan terutama menginfeksi saluran pernapasan atas dan saluran pencernaan mamalia dan burung. Meskipun sebagian besar anggota keluarga coronavirus hanya menyebabkan gejala mirip flu ringan selama infeksi, SARS-CoV dan MERS-CoV dapat menginfeksi saluran udara bagian atas dan bawah serta menyebabkan penyakit pernapasan parah dan komplikasi lainnya pada manusia.
2019-nCoV baru ini menyebabkan gejala yang mirip dengan SARS-CoV dan MERS-CoV. Orang yang terinfeksi dengan virus korona ini menderita sebuah respon berupa peradangan yang parah.
Sayangnya, tidak ada vaksin atau pengobatan antivirus yang disetujui tersedia untuk infeksi coronavirus. Pemahaman yang lebih baik tentang siklus hidup 2019-nCoV, termasuk sumber virus, bagaimana penularannya dan bagaimana replikasi diperlukan untuk mencegah dan mengobati penyakit.
Penularan zoonosis
Baik SARS dan MERS diklasifikasikan sebagai penyakit virus zoonosis, yang berarti pasien yang pertama kali terinfeksi, mendapatkan virus ini langsung dari hewan. Ini dimungkinkan karena selama berada di inang hewan, virus ini telah memperoleh serangkaian mutasi genetik yang memungkinkannya untuk menginfeksi dan berkembang biak di dalam manusia.
Sekarang virus ini dapat ditularkan dari orang ke orang. Studi lapangan telah mengungkapkan bahwa sumber asli SARS-CoV dan MERS-CoV adalah kelelawar, dan bahwa musang bulan (masing-masing adalah mamalia asli Asia dan Afrika) dan unta, masing-masing, berfungsi sebagai inang antara kelelawar dan manusia.
Dalam kasus wabah koronavirus di tahun 2019 ini, sebuah laporan menyatakan bahwa sebagian besar kelompok pasien pertama yang dirawat di rumah sakit adalah para pekerja atau pelanggan di pasar lokal grosir makanan laut yang juga menjual daging olahan dan hewan konsumsi seperti unggas, keledai, domba, babi, unta, rubah, musang, tikus bambu, landak dan reptil.
Namun, karena tidak ada yang pernah melaporkan menemukan coronavirus yang menginfeksi hewan air, masuk akal bahwa coronavirus mungkin berasal dari hewan lain yang dijual di pasar itu.
Hipotesis bahwa 2019-nCoV melompat dari binatang di pasar sangat didukung oleh publikasi baru dalam Journal of Medical Virology. Para ilmuwan melakukan analisis dan membandingkan urutan genetik 2019-nCoV dan semua coronavirus lainnya yang diketahui.
Studi tentang kode genetik 2019-nCoV mengungkapkan bahwa virus baru ini paling erat kaitannya dengan dua sampel kelelawar yang mirip SARS dari Cina, awalnya menunjukkan bahwa, seperti SARS dan MERS, kelelawar mungkin juga merupakan asal dari 2019-nCoV.
Para penulis selanjutnya menemukan bahwa urutan pengkodean DNA dari protein spike 2019-nCoV, yang membentuk “mahkota” partikel virus yang mengenali reseptor pada sel inang, menunjukkan bahwa virus kelelawar mungkin telah bermutasi sebelum menginfeksi orang.
Tetapi ketika para peneliti melakukan analisis bioinformatika yang lebih rinci dari urutan 2019-nCoV, itu menunjukkan bahwa coronavirus ini mungkin berasal dari ular.
Dari kelelawar hingga ular
Para peneliti menggunakan analisis kode protein yang disukai oleh coronavirus baru dan membandingkannya dengan kode protein dari coronavirus yang ditemukan di host hewan yang berbeda, seperti burung, ular, marmut, landak, manis (trenggiling raksaksa), kelelawar dan manusia. Yang mengejutkan, mereka menemukan bahwa kode protein pada 2019-nCoV paling mirip dengan yang digunakan pada ular.
Ular sering berburu kelelawar di alam liar. Laporan menunjukkan bahwa ular dijual di pasar makanan laut lokal di Wuhan, meningkatkan kemungkinan bahwa 2019-nCoV mungkin telah melompat dari spesies inang – kelelawar – menuju ular dan kemudian menuju manusia pada awal wabah koronavirus ini.
Namun, bagaimana virus dapat beradaptasi dengan inang berdarah dingin dan berdarah panas masih menjadi misteri.
Penulis laporan dan peneliti lain harus memverifikasi asal virus melalui percobaan laboratorium. Mencari urutan 2019-nCoV pada ular akan menjadi hal pertama yang dilakukan. Namun, sejak wabah, pasar makanan laut telah didesinfeksi dan ditutup, yang membuatnya sulit untuk melacak hewan sumber virus baru.
Pengambilan sampel DNA dari hewan yang dijual di pasar dan dari ular dan kelelawar liar diperlukan untuk mengkonfirmasi asal virus. Meskipun demikian, temuan yang dilaporkan juga akan memberikan wawasan untuk mengembangkan protokol pencegahan dan pengobatan.
Wabah 2019-nCoV adalah salah satu pengingat bahwa orang harus membatasi mengkonsumsi hewan liar untuk mencegah infeksi zoonosis.
Haitao Guo , Profesor Mikrobiologi dan Genetika Molekuler, Universitas Pittsburgh ; Guangxiang “George” Luo , Profesor Mikrobiologi, Universitas Alabama di Birmingham , dan Shou-Jiang Gao , Profesor Mikrobiologi dan Genetika Molekuler, Universitas Pittsburgh .
Artikel ini diterbitkan ulang dari The Conversation baca artikel aslinya .
